Dos zonas naturales protegidas están presentes en el territorio del Puerto de Riga: Milestibas Island (Love Island) que forma parte de un parque natural nacional de Letonia (SeaSide Nature Park / Piejūra nature park) y la reserva natural de Krēmeri, fundada en 1993 y declarada de interés nacional en 1999. Esta reserva es un importante lugar de anidación para algunas aves acuáticas protegidas en Letonia y en Europa.


Su monitoreo científico fue iniciado hace varios años, en colaboración con la Agencia de protección de la naturaleza y de los ornitólogos, y el Puerto de Riga ha realizado varios trabajos que han permitido mejorar sus biotopos y sus condiciones de anidación.

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